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何川教授主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究

  来自芝加哥大学、纪念斯隆凯特琳癌症中心的研究人员报告称,他们开发出了一种高度敏感、强大的方法分析液氮罐罕见细胞群的全基因组5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)。研究成果发布在7月28日的《分子细胞》(Molecular Cell)杂志上。

  著名华人学者、芝加哥大学的何川(Chuan He)教授,与纪念斯隆凯特琳癌症中心的Ross L. Levine是这篇论文的共同通讯作者。何川教授主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究。近年来在甲基化修饰,尤其是液氮罐5hmC和m6A等方面获得了许多重要的发现。

  迄今已在Nature,Science等国际权威学术期刊发表了150余篇论文。曾荣获美国癌症研究青年科学家奖,凯克基金会医学研究杰出青年学者奖等多个奖项,并当选为顶级生命医学研究院HHMI研究员。

  今年1月,何川教授在Cell新子刊液氮罐Cell Chemical Biology上发表文章,全面探讨了与基因表达调控有关的多种核酸修饰。何川教授对核酸修饰领域的发展史进行概述,着重介绍了核酸修饰鉴定和功能探索中取得的最新进展。

  文章覆盖了许多在生物系统中起重要调控作用的核酸修饰,包括DNA上的5mC及其衍生品、6mA,mRNA和长非编码RNA上的m6A、假尿嘧啶(Ψ)和m5C。此外,文章还简单阐述了其他非编码RNA(何川教授全面解读核酸上的那些液氮罐修饰 )。

  2月,何川教授和芝加哥大学的Dan Dominissini,及以色列特拉维夫大学的Gideon Rechavi博士领导研究人员,描绘出了真核细胞信使RNA(mRNA)中动态的N1甲基腺苷(N1 methyladenosine,m1A)甲基化组。这一研究成果发布在Nature杂志上(何川教授Nature阐析新型RNA修饰 )。

  7月2日,学术期刊《eLife》在线刊登了何川教授和液氮罐俄亥俄州立大学Li Wu领导的一项研究成果。研究结果指出了HIV-1 RNA的m6A修饰在病毒感染和HIV-1蛋白合成过程中所发挥的作用(何川教授eLife最新表观遗传学成果 )。

  被称为“第六种碱基”的5hmC广泛分布于多种哺乳动物的组织和细胞中,与胚胎发育、神经系统功能以及肿瘤研究高度相关。与5-甲基胞嘧啶(5mC)相比,5hmC在组织中含量更低,难以精确地检测。随着研究的深入,5hmC参与的重要生物学液氮罐作用逐渐被人们发现,同时也促使着5hmC的检测和定量方法不断发展。

  为了区分5hmC与其他胞嘧啶衍生物,很多利用化学或酶学修饰实现靶向检测或非靶向富集5hmC的方法应运而生。因此,选择并发展灵敏、准确、可靠的5hmC检测技术对于表观遗传研究至关重要。

  在这篇文章中,研究人员描述了一种高度敏感的选择性化学标记和捕获方法,采用分离自约1,000个细胞的DNA全基因组分析5hmC,他们将之命名为nano-hmC-Seal。利用这一技术,研究人员评估了跨越不同的造血分化阶段液氮罐5hmC的分布和动态。

  采用Nano-hmC-Seal分析Tet2突变的纯化小鼠急性髓性白血病(AML)干细胞,他们发现相比正常干细胞它们具有一些白血病特异性、差异性羟甲基化区域,这些区域包含一些具有不同5hmC峰的已知和候选疾病特异性靶基因。在液氮罐AML中5hmC模式的改变与差异性基因表达密切相关,证实了在AML中5hmC动态改变对调控转录起重要作用。

  新研究为在体内疾病模型及有限的临床样本中研究和检测DNA甲基化动态提供了一种有效的方法。

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